El Programa de Postgrado en Agronomía se especializa en la Producción Sostenible y ofrece cursos de Máster y de Doctorado. Su objetivo es formar a profesionales de alto nivel relacionados con las Ciencias Agrícolas, cuyos objetivos sean actuar en la educación superior, en instituciones o compañías públicas o particulares. Los estudiantes son capaces de desarrollar la investigación y la tecnología en las áreas de suelo, agua y producción de cultivos, basadas en el uso sostenible de los recursos naturales, sobre todo en la región del Cerrado brasileño.

Los cursos de Postgrado en Agronomía comprenden tres líneas de investigación: 1) El suelo, el agua y la calidad del medio ambiente; 2) Recursos genéticos y mejoramiento de las plantas; y 3) Los sistemas de producción agrícola sostenible.